Bạn có thể dùng pure Python module từ Jython. Không thể dùng module được implement bằng C. Để dùng module từ pip install, bạn cần thêm sys.path của Python vào Jython vì Jython không tự động lấy thông tin PYTHONPATH.
Jython 2.5 giới thiệu biến môi trường JYTHONPATH – tương đương PYTHONPATH của Jython, nên đặt cả hai cùng giá trị sẽ giải quyết được hầu hết trường hợp (trừ khi setup với phiên bản Python và Jython không tương thích).
Sau đó bạn có thể import trực tiếp module Python cài local bằng import trong Jython.