Bạn có thể sử dụng mô-đun python thuần túy từ jython. Bạn không thể sử dụng các mô-đun được triển khai trong C. Để sử dụng các mô-đun từ lượt cài đặt pip của mình, bạn cần thêm đường dẫn sys.path của python vào đường dẫn của Jython vì Jython không tự động nhận thông tin PYTHONPATH
Jython 2.5 đã giới thiệu biến môi trường JYTHONPATH dưới dạng Jython-tương đương với PYTHONPATH, vì vậy việc đặt cả hai thành cùng một giá trị sẽ thực hiện thủ thuật đối với hầu hết các trường hợp sử dụng (trừ khi bạn đang làm việc trong thiết lập với các phiên bản Python an Jython không tương thích).
Giờ đây, bạn có thể nhập trực tiếp các mô-đun python được cài đặt cục bộ bằng cách sử dụng 'import' trong Jython.